叶桂治疗女科疾病的主要学术思想是强调奇经八脉，认为奇经八脉是维持女子经、带、胎、产的主要机制，其论及月经生理时云：“思经水必诸路之血，贮于血海而下。其不致崩决淋漓者，任脉为之担任，带脉为之约束，维 脉为之拥护，督脉以总督其统摄”，论及不孕及崩漏病理时云：“不孕经不调，冲脉病也”“肝肾内损，延及冲任奇脉，遂至经漏淋漓”，至于产后淋痛病机“都是冲任奇脉内怯”。叶桂之所以如此重视奇经，是因为胞脉不仅沟通与子宫的联系，而且直接与心肾两脏相联系，其心血、肾精、天癸可直接或间接通过胞脉而注入胞宫，使其按期行经及孕育胎儿。

叶氏认为奇经八脉具有蓄贮十二经脉充盈之气血的功能，故为“十二经脉之海”，具有“担任”“约束”“总督”“维续”“护卫”“包举”全身阴阳、气血、脏腑、津液之正常运行的生理功能。如《临证指南医案·崩漏》云：“任脉为之担任，带脉为之约束，维 脉为之拥护，督脉以总督其统摄。”十二经脉如江河，奇经如湖泽，江河水满则溢入湖泽，故湖泽有涵蓄水量和调剂江河之水的作用。另外，十二经脉载营气血而周历人体，流转不息；奇经则涵蓄人身精血和阴阳真气，灌溉于体内组织，起着内温脏腑，外濡腠理的作用。

奇经八脉不仅在生理上有着密切联系，在病理上也会相互影响，既可单独一条经脉发生病变，也可多条经脉同时受病，如《临证指南医案·产后》篇治疗徐氏患者中提出：“冲脉逆，则诸脉皆动”。与同篇陈氏“冲任督带伤损，致阴阳维 不用”，还有治疗朱姓案：“产后冬月，右腿浮肿，按之自冷。若论败血，半年已成痈疡。针刺泄气，其痛反加。”叶桂认为此因于产后，故“冲任先虚，而致维 脉不用。”此说明八脉之间可相互影响致病。且奇经与脏腑之间的病理也可以相互影响，凡肝、脾、胃之病，久虚不复，精血亏损，势必延及奇经。如《临证指南医案·产后》治疗郭氏下损及胃奇脉虚案中载：“奇经八脉皆丽于下，肝肾怯不固，八脉咸失职司……下损及胃，食物日减”。此说明奇经有病，亦可以影响至脏腑，但不论是脏腑影响至奇经或是奇经影响至脏腑，均与肝肾的关系最为密切。盖肝肾内藏精血，灌输于奇经。“肝肾下病必留连奇经八脉，不知此旨，宜乎无在”。叶桂之论说明奇经依附于肝肾，肝肾虚损，精血耗乏，必累奇经致病，即“下元之损必累八脉”。

叶桂根据奇经八脉的生理病理特点，提出了调补肝肾是治疗奇经的主要法则。奇经虽察于肝肾，但又依赖脾胃水谷之气的涵养，脾胃旺盛，八脉由此而充实，以任固摄之职。如果阳明久虚，脉不固摄，有开无合，亦致奇经之病，故叶桂治奇经又时时不忘顾护脾胃。叶桂倡导填补奇经，应取血肉有情之品。其谓：“夫精血皆有形，以草木无情之物为补益，声气必不相应。桂附刚愎，气质雄烈，精血主脏，脏体属阴，刚则愈劫脂矣。余以柔剂阳药通奇经不滞，且血肉有性，栽培身内之精血，但王道无奇功，多用自有益”。故叶桂对奇经虚证多取血肉有情之味，如鹿茸、鹿角胶、紫河车、龟板、鳖甲、淡菜等。这是其奇经用药的一个显著特点。他在用药上同时强调奇经不同，治法各异。如冲脉之病，叶桂根据《难经·二十一难》“逆气而里急”的记载和“冲为血海”“冲为气血要冲”的生理特点，强调治冲脉以调畅气血为主，多选用川楝子、香附、郁金、降香、乌药、元胡、芫花等品。又因“冲脉隶属阳明”，故又有通补阳明之法，常用半夏、厚朴、茯苓、姜汁等品。任脉主一身之阴，为“阴脉之海”，首选龟板以补任脉，因“龟体阴，走任脉”。任脉虚热又可采黄柏、知母、生地之属。督脉主一身之阳、其病多为阳气虚损，他主张以阳剂柔药调之，因“鹿性阳入督脉”，故多取鹿茸、鹿角胶、鹿角霜等配以补肾之品。带脉为病多见下焦不固，常见带下淋浊，除补肝肾外多配五味子、莲子肉、芡实、金樱子、山药等品。

以上是叶桂奇经治法大略，其宗旨是以调补肝肾为主，兼顾阳明。实者治以通，虚者治以补，攻要缓攻，补要通补，虚中夹实，通补兼施，或温奇经之阳，或育奇中之阴，或降奇中之逆，或涩奇经之脱，通补固涩，相得益彰，灵活巧用，至精至妙。而结合具体女科疾病，又可归纳为：

女子经水失调，前贤多从冲任失调立论，治法亦以养血居多。惟明代张介宾倡女子“三本说”，即冲脉为月经之本，阳明为冲脉之本，心脾为生化统摄血脉之本。叶桂旁通其说，认为冲脉为血海，经水由血液所化，而冲脉又赖胃气为其化源，心脾为其统摄，且女子以肝为先天，所以，妇人化源充沛，冲任盈满，情志舒畅，气血通调，经水自能常至。反之，若是化源不足，血海亏损，心脾不能统摄，便可影响冲脉而致月经不调。倘若肝气横逆，侵犯胃气，可令化源窒塞；或是肝血不足，或者肝的调血功能障碍，亦可直接影响胃气、心脾、冲脉而导致月经不调。因此，调经不仅应重视调治心脾、胃气、冲“三本”，而且尤应重视调肝。肝主疏泄，协调气机，且有藏血之功。因此，叶桂在治肝调经时，尤重“气血”。病于气者，多因“少欢悦，多愁闷”而致肝郁气滞，治以“通剂”：病于血者，分别可见血瘀、血虚、血寒、血热诸证。若肝枯血闭者，养血柔肝为上；血瘀经愆者，活血理血为要；血寒血热者分别投以温通或凉清之剂。总之，肝气顺，气机调，脾胃健，化源充，血海盈，气血和畅，月事当调。这便是叶桂调经重肝重本的治疗特色。

带下病为女子常见病证，历代医家多从湿热、寒湿、脾虚、肾虚立论。而天士认为，“带下”多属“奇脉空虚”或“八脉无气”而“不司束固”，治宜“通摄之剂”。且“通则达下，清则固下”，八脉通达，带下自已。断不可滥用刚燥之剂。因为带下如注，必液耗阴伤，若误投附桂之属，便会招致“劫阴不效”之后果。然而，过分阴柔之品也需慎用。因为“骤用阴药，则有防胃纳矣”，“阴药沉降，徒扰其滑耳”，反而会使带下加重，皆非奇经治法，即使阴液耗损日甚，偶见内风日动，也只能“竣下柔剂，和其阴阳”。因此，无论是带下阴冷者，或是带下黄白未净者，或是日久不止者，均以调摄八脉为主，然后根据寒热燥湿之性，或温养，或清养，或佐通利之品。足见叶桂的治带之法是独具匠心的。

妇人以血为本，血海充盈，流行常道，按月而至，方为正常。若非行经之时，反而暴崩注下，或淋漓不断，是为“崩漏”之证。究其病因，有因肝不藏血者；有因脾不统血者；有因热在下焦，迫血妄行者；有因元气大虚不能敛血者；亦有因血瘀而血不归经者。诸种因素又可导致冲任不固，摄血无权，崩漏不止。因此，叶桂治疗崩漏，以固摄冲任为恪守，进而溯其原由分而治之。如肝气郁结，脾气亏损者，用人参逍遥散之类；因血瘀久漏不止者，用泽兰之属；因中焦气虚不能摄血者，首选参芪；因下焦元气火衰者，以鹿角霜、炮姜或附子理中温摄为先；血热暴下者，用旱莲、地榆急塞其源。总之，不是“见血治血”，而是究其因，分其治，以固摄冲任为关键。

叶桂治疗胎动不安有两大特色：其一，参考妊娠月份，采用不同的安胎之法。他认为，妊娠三月，多为肝气攻冲，即使有吐红痰之肺系病证，仍以平降肝气为主，其言：“殒胎多在三月，是因肝血虚损，不养胎元而致”，“怀娠百日，丙丁养胎”，丙丁属火，征见火象，当养阴制火；“五六月当脾胃司胎”，此时正是胎儿蓬长之际，理应脾胃健旺，化源充足，方能滋养胎元。此际若是罹患病证，用药当重脾胃，不可肆行攻伐，以伤助长之源。娠八月，见血热或肝风病证，治宜“凉血”或“息风和阳”。参照胎龄辨证，施用安胎之法，这无疑给后人临证以启迪。但是，人各有异，虽然生长规律一样，因体质、禀赋和其他外因的影响，出现的病证则不尽一致。因此，第二特点就是有邪当除邪，“正虚当复正，病去身安，自为不补之补”，“以偏求偏，幸勿畏虚以遗患”，谆谆告诫我们，有是证即用是方，叶桂的这一观点与“有故无殒，亦无殒”之旨意相通。

产后病证，临床颇不乏见。张机曰：“新产妇人有三病：一者病痉，二者病郁冒，三者大便难。”后代不少医家又多倡“产后多虚多寒”之说，药施辛热之品。而叶桂则认为，产后多虚多瘀。虚者，阴阳气血之虚损也，临证当辨孰轻孰重，投以补气、助阳、养血、滋阴为治。《叶天士晚年方案真本·杂证》曰：“产后不复元，血去阴伤骨热，大凡实火可用清凉，虚热宜以温补，药取味甘气温，温养气血，令其复元，但产伤之损，蓐劳病根，全在肝肾，延及奇经八脉，非缕杂治所宜”，此温药，是温养之义，非温热之谓，提出了温补的重要性。在用药上人参、紫河车、紫衣胡桃为产后温养常用药。与此同时，叶桂也指出体内正气固然已虚，绝不可单用扶正之剂，因为单纯扶正，非但正不复，反会纵邪贻患，更伤其正，故宜祛邪扶正，有表邪需注重解表，有火邪当注重清热。如叶桂在暑伤营阴案中指出：“初病舌赤神烦，产后阴亏，暑热易深入，此亟清营热，所谓虑虚其阴”。在竹叶连翘解热的基础上，因其阴血不足故加入滋阴药，如生地黄、麦冬、玄参等。这样邪去正复，症状得解。另外产后由于耗伤气血，体质虚弱，加之内外因素的影响，血行失度，瘀结于脉中，治法宜通。有患者初产，汗出眩晕，胸痞，腹痛，常用山楂、赤芍、炒牛膝、益母草等活血化瘀，更加延胡索、郁金、香附等行气消瘀以止痛，诸药配伍，使恶露祛，新血生，疾病随之痊愈。故恶露不下，常可成为致病之因，宜通；若因瘀而致淋漓者，乃宜通因通用之法，以通塞流；产后失血过多而致阳气上冒者，“开泄则伤阳，辛热则伤阴，俱非新产郁冒之治道”，当用滋阴潜降之品。他还认为，产后血海、冲任空虚，外邪陷入易耳。诸如暑热寒湿之邪均可乘虚而入，酿成病症。祛邪扶正，如此清上勿得碍下，便是“理邪”。即做到除邪不伤正，扶正不恋邪，并行不悖。正如张介宾所云：“既有表邪，不得不解；既有火邪，不得不清；既有内伤停滞，不得不开通消导”。叶桂学宗明哲，不拘守“产后多虚多寒，宜温宜补”之说。

“络病学说”源于《黄帝内经》，发展于《伤寒杂病论》，而成熟于叶桂。叶桂所说的“络”指血络而言，久病入络是指某些慢性疾患迁延日久，病邪深入，血络受病。《难经·二十二难》指出：“气留而不行者，为气先病也；血壅而不濡者，故血后病也。”说明气病与血病原有一定的先后传变次第，叶桂在其临床实践中也发现了这一规律。认为“初病湿热在经，久则瘀热入血”，“其初在经在气，其久在络在血”。疾病传变的一般规律是由气及血，由经至络。气与血、经与络之间的传变经过了一个较长的传变过程。邪气一旦入络，就会形成“瘀”，即络脉瘀阻。一个“久”、一个“络”，准确地揭示了久病入络的病机特点。由其病机特点所决定，久病入络有其特殊的证候表现。其特征性证候是癥积有形，着而不移。叶桂指出：“初病胀痛无形，久则形坚似梗，是初为气结在经，久则血伤入络。”邪入血络，瘀阻成形，故望之高突有形，触之着而不移，是为络病的显著特征。络病的另一个特征性证候是久痛。血络瘀阻不通，故而作痛。然初作之痛未必就是络病，只是久延之痛才有可能是络病之痛。正如叶桂所说：“久痛必入络。”络病之痛又有虚实之分，瘀实则痛而拒按，络虚则痛而喜按。叶桂所谓“络虚则痛”，“痛而重按少缓，是为络虚一则”。所谓络虚，并非指纯虚无邪，应当理解为虚中夹瘀，虚瘀兼夹。“凡久病，病必在络，络空必成胀满”，盖经脉纵行，络脉横行。络脉为连接经脉与脏腑、肌肉、器官左右、前后、内外之通路。经脉与络脉虽均为气血所充盈，而经脉以气为主，故能贯彻上下，统领全身气血之运行。络脉以血为主，故为器官、肌肉间营养传输之通路。一旦脏腑气血虚弱，则经脉必然空虚，然此时病尚在气分。若再发展累及络脉，则络脉之营血空乏，通路亦为之不畅。脏与脏之间，气血不周且渐次虚衰。腑与腑之间，传输失衡、气机不运则成胀满。气血不继则空虚处自虚，而郁滞处自郁滞。此时气病延及于血，甚者久郁化水，癥瘕、水臌等病由是而成矣。总之，叶桂认为络病传变由经到络，由气及血，虚实交结为病机，以胀、痛、水、实为临床表现，尤其妇科癥瘕病常以此四症并见，值得临床观察和总结。

在癥瘕病的治疗上，叶桂强调攻补兼施，药用“辛香入络”之品。治疗取法于张机鳖甲煎丸：“疟发既多邪入于络。络属血分，汗下未能逐邪，仲景制鳖甲煎丸一法，搜剔络中伏留之邪，五六日必效”。疟疾失治，迁延日久，邪入血络，发为疟母，结于胁下，仲景治以鳖甲煎丸，内有虫蚁类飞行走窜之品。叶桂于此而悟出络病治法。他说：“考仲景于劳伤血痹诸病，其通络方法，每取虫蚁迅速飞走诸灵，俾飞者升，走者降，血无凝滞，气可宣通，与攻积除坚，徒入脏腑者有间”。叶桂据此而制定了络病的治疗大法：“通血脉，攻坚垒，佐以辛香行气，是络病大旨”。通血脉，攻坚垒是治疗络病的主要方法。络虚则胀，气阻则痛者以辛香苦温入络通降。久病入络，虽说邪气痹阻络分为实，然病既久延，正气多已受伤，故治疗不可企求速效，当以丸剂缓攻为上。即叶桂所说“久病当以缓攻，不致重损之义”。攻补兼施是其治疗络病的思路和方法，值得借鉴。其用药与一般的活血化瘀药有所不同，须借助于虫蚁飞走之属，如水蛭、虻虫、地鳖虫、穿山甲、蜂房、鳖甲、地龙、全蝎、蜣螂等。辛香行气也是治疗络病所不可或缺的。因为攻坚通脉之剂，“非辛香无以入络”。辛香之品，宣通气机，具有将诸药领入络中的作用，药如小茴香、青陈皮、薤白汁、川楝子、延胡索等。故治疗络病，选药常常以辛为用，如辛润之品当归须、桃仁、柏子仁等，具流通之性，善能入络通脉；辛温善散络中沉寒，如乌头、桂枝、吴茱萸、姜汁等；辛咸善能入络软坚散结，如瓦楞子、牡蛎、鳖甲、全蝎等。