从信息学霸到神级科学家
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第61章 难道真是变形金刚的意思?

蛋白质结构预测模型的训练比江铭的预计要慢了不少。

已经在服务器上跑了三天,竟然还没训练完。

搞得江铭有些焦虑,一天登上服务器看八百次loss曲线,祈祷着曲线赶紧收敛。

这焦虑的原因倒不是因为他自己,而是最近这两天也不知道高志师哥怎么回事,隔几个小时就跑过来问一次训练的怎么样了。

江铭正趴在实验室的桌子前,拿着笔在草稿纸上写写画画,冥思苦想能怎么改进一下transformer的模型。

不过系统设计的东西,岂会是那么好改的,江铭磨蹭了一个小时也没想好该怎么做。

忽然,他的肩膀被人拍了一下,江铭无奈地转过头去,果然是高志。

高志冲他露出一个和蔼微笑,开口道:“训练得怎么...”

“训练得怎么样啊?”,江铭同步开口,两个人的声音直接重合到了一起。

“额,你怎么知道我要说什么?”,高志挠了挠头,有些尴尬。

“师哥,你最近是没有自己的事情做嘛?”,江铭无奈地叹气,道:“而且,你到底是怎么进来的,简直是把我们实验室当你自己家一样。”

“还没有脚步声!刚刚你都吓我一大跳你知道吗。”

“额...不用在意这些细节,这只是一个侦探的基操罢了。”,高志干脆搬了个椅子坐在江铭身边看他工作:“你这个训练怎么花了这么久啊,就不能多用几台机器训练吗?”

“哎,我也想啊,但是做不到啊。”,江铭叹道:“多台机器处理数据是可以的,但是最关键的训练那一步,还是只能在一台机器上训练的。算了,说多了你也不懂。”

高志却是来了兴趣:“那你就给我讲讲呗,反正在这里等着训练也没事做。”

江铭无奈,点了下头算是答应了高志的请求,拿出一张新的草稿纸,在上面画了起来。

“蛋白质结构预测这个任务,我不知道你们生命科学界怎么分析。从信息学的角度,我把他定义为一个高维输入输出,且具有超远距离依赖关系的一个序列预测问题。”

“而我画的这个图,是我为了解决这类问题专门...额,设计的。我给他起名叫transformer。”

“为什么要叫它变形金刚?”,高志一脸疑惑地问。

“变形金刚?你在说什么,什么变形金刚?”

“就是那个机车人的动画片啊,老早之前就有了,最近还出了新作呢,里面的机车人甚至都能合体了。”,高志一边用嘴发出机械音,一边做了个机器人变形的动作:“你的模型也能合体吗?”

江铭只感觉话题被高志带的越来越偏,师哥在耍宝上的天赋似乎比在科研上的天赋还高。

不过他还是一本正经地回答道:“模型的话肯定是不能合体的,这种序列预测问题,神经网络在时间步上需要一步步迭代,没法...”

等等,不对!

江铭突然意识到自己之前陷入了误区!

他之前训练神经网络来解决序列预测问题的时候,用的都是LSTM、RNN这种循环神经网络,的确需要一步一步在时间方向做迭代。

但是,transformer的核心部分不是循环的,根本没有在时间步上的信息传递,而是一个全参考的相关性计算!

这岂不是意味着,这个模型是可以分布式并行训练的,在不同机器上训练也没关系,最后把模型“合体”,就可以了。

“师兄,你有大才啊!这个模型还真可以这么做!”

“哈哈,我有这么厉害吗?虽然听不懂你的话,但是按你的意思,是不是可以靠多加电脑来加速训练了?”

“是的,可以的!师哥,你可以帮我问问吕教授吗,我想借用你们实验室的服务器几天时间。”

“啊?借我们实验室的服务器吗,我们实验室的服务器是做冷冻电镜的数据分析的...”

高志张口就想拒绝,冷冻电镜是通过电子轨道扫描技术来拍摄分子的,如果不经过服务器的分析处理,就没法获得分子的图像。

这几乎关系到了他们实验室的命脉!

但是高志骤然想到,两天前吕教授在电话里叮嘱他的话,说是要满足江铭的一切科研要求,江铭的要求就等同于是她的要求。

“额...可以的,师弟你尽管用,只要能帮到你,我替吕教授答应了!”

江铭狐疑地看着高志,师哥在实验室竟然权力这么大么,这怕不是要反?

不过既然答应了,江铭也没再多嘴问,立刻打开电脑,调出编程界面开始噼里啪啦地敲起键盘来。

“师哥,你稍等一下,我改一下代码。”

高志倒也不着急,安静坐在一旁陪着江铭改程序。

半个小时过去,江铭终于抬起头来,结束了编程。

他把电脑上的U盘拔下来递给高志:“师哥,这个是我改好的程序,还带来一个通信接口,可以直接把模型传到我这边。你回实验室把这个安装到服务器跑起来就好。”

高志目不转睛地盯着江铭,一副看怪物的表情:“你是说,你半个小时,不但改了程序,还给程序装了个通信接口?”

“是啊,为什么这么问?师哥你们实验室网不会有问题吧?”

“我们实验室网没问题,但是你有问题,而且有大问题!”,高志接过U盘,头也不回地走了。

江铭看着师哥离去的背影,心中默默思索。

难道系统给模型起名叫transformer,真的是变形金刚的意思吗,暗示能合体?

...

高志昂首挺胸地回了实验室。

路过的师弟向他打招呼:“高师兄,你刚刚去哪里啦,一直没在实验室看到你。”

高志招了招手:“你来得正好,快帮我叫一下其他人,我有要事宣布。”

不一会儿,高志带着几人来到冷冻电镜面前,一脸严肃地道:“相信大家也注意到了最近学院里的风声,据说我们实验室的科研目标要增加一倍!”

此话一出,众人一片哗然,然而高志话锋一转。

“但是,幸好吕教授早就为实验室找到了一条明路,和我们学校最近崛起的天才研究员江铭,合作进行计算机辅助预测蛋白质结构的研究。”

“所以,最近实验室冷冻电镜暂停使用,我们把服务器支援给信息学实验室那边并行训练模型,尽最大力量,支持江铭的科研工作!”