在各国新登记病例中，病原学阴性肺结核病例占肺结核总病例的比例为20%～80%，发达国家多低于50%，部分发展中国家其比例高达80%。2011—2018年我国登记病原学阴性肺结核病例占肺结核总病例的比例为50%～70%（图1-1）。

病原学阴性肺结核比例高的原因是：①痰液收集和检查程序不规范；②患者痰标本含菌量少，痰液内含菌5 000条/ml时，涂片阳性率（涂阳）约50%，<1 000条/ml时则下降至4%，未经治疗的2cm直径大小的肺部结节病变，其结核菌含量约100～1 000条，而同样大小的结核性空洞，菌数要高出约1万～10万倍；③肺部病灶局限，未与引流支气管相通；④临床诊断的部分病原学阴性肺结核为非活动性肺结核。