分子流行病学问世近半个世纪来，在阐明人群和生物群体中医学相关的生物标志的分布及其与疾病及健康的关系和影响因素，研究并制定防治疾病、促进健康的策略与措施方面取得了瞩目的成就。分子流行病学具有两个鲜明的特点：以流行病学现场研究为基础；以生物学标志研究为核心内容。可以说分子流行病学是将宏观水平研究疾病或健康事件分布规律与微观水平研究疾病或健康事件相关生物学标志的分布规律及影响因素密切结合起来，为制定疾病的精准预防和有效控制以及健康促进的策略和措施提供科学依据。分子流行病学理论发展快且实践性强，对推动流行病学、预防医学、临床医学等医学研究的作用越来越显著。那么，如何做好分子流行病学病研究设计，是每一个研究者必须认真思考的问题。值得提出的是，分子流行病学研究仍然是属于流行病学研究的范围，其研究设计首先应遵循流行病学研究设计要点，要建立研究目的或假设，明确研究内容，确定流行病学研究类型，明确测量方法，确定分析方法，明确预期分析指标及有效质量控制措施等，如果背离了这些流行病学研究设计的基本要素，即使采用了新颖的生物学标志物，都很难在防治疾病和促进健康方面作出有意义的研究成果。当然，选择探讨适宜的生物学标志，是达到暴露和效应的精确测量、易感性的深入研究以及结局的准确描述必不可少的条件，也是分子流行病学区别于传统流行病学研究的基本点。