2.1.1 早期三股螺旋的简易画法
Ⅰ型胶原由三条肽链组成,其中两条相同,称为α-1链;另外一条不同,称为α-2链。三股螺旋的简易画法可以不考虑三条肽链的差异,用相同的形式表现三条肽链。例如图2.1所示的胶原与单宁的相互作用,其中的三股螺旋则是用最简单的方法绘制的三股螺旋(用“Chains”画一条碳链,然后复制、粘贴出两条一样的碳链,然后错列排布,最后修饰一下即可)。
图2.1 胶原与单宁的相互作用(一)
当然也可以通过改变一下氢键的绘画方式,使画面略为丰富一些,如图2.2所示。
图2.2 胶原与单宁的相互作用(二)
上述两种画法的另一个区别是第二种画法中基团看起来不会太凌乱。虽然这种方式没有深入区分三条肽链的差异,但可以通过颜色来区分,例如将一条肽链设置为蓝色或其他颜色以示区分。这也是后述区分三条肽链的一个重要方法。
另外这里也涉及曲线箭头的画法,在此也略作介绍。首先选择“Arrows”里的一种箭头形状,画出一个箭头,然后将光标置于箭头上,至箭头上呈现出如图2.3所示的形式。注意不要选择“Marquee”或“Lasso”工具选定箭头。
图2.3 ChemDraw中目标的一种选定方式
将光标放置于箭头的中部,向上或向下拉动鼠标,则可绘制出弯曲的箭头,效果如图2.4所示。其中,向上或向下拉动鼠标时会显示一个角度,表示最终形成的弧形角度,绘制时可根据实际情况选择弯曲幅度。
图2.4 弯曲的箭头
如需改变箭头的长短,仍按上述方法将光标移动至目标箭头的顶端或尾端,箭头上出现蓝色圆圈标记时拉动箭头,则可调整箭头的长短。另外,使用“Marquee”或“Lasso”工具选定其中一个箭头,点击右键然后选择“Full Arrow at End”并去掉“Full Arrow at Start”的选项,可设置或变换箭头的方向,最终效果如图2.5所示。当“Full Arrow at Start”与“Full Arrow at End”均选中时,则可绘制双向箭头。
图2.5 设置或变换箭头的方向
这里简要介绍了曲线箭头的绘制方法,实际上这也是将直线进行弯曲(绘制曲线)的方法,后述众多曲线的绘制都是采用这种方法完成的,不再赘述。