真核生物是其细胞具有真正细胞核的单细胞生物和多细胞生物的总称，包括动物、植物、真菌和其他具有由膜包裹着的复杂亚细胞结构的生物。真核微生物是形体微小、结构简单的真核生物的统称，包括真菌、单细胞藻类和原生动物。而原核生物没有真正细胞核和膜结合的细胞器，包括细菌和古生菌两大类。原核生物与真核生物在细胞结构等方面具有较大差异（表3-1）。
真核微生物的三个主要分支为：酵母、霉菌、蕈菌。
表3-1 原核生物与真核生物的比较
