标准系统的结构，就是指标准系统要素的内在的有机联系形式。任何一种标准系统的要素都按照一定的次序排列或组合。如果仅有标准的简单集合，还不能说这就是标准系统。系统是在要素基础上，以某种方式相互联系，以某种结构排列组合，形成整体结构，这时才具有系统的性质。标准系统的结构是现代标准化理论中一个重要的课题，系统的结构是系统具有特定功能、产生特定效应的内在根据，而且系统效应的大小，在很大程度上也是取决于系统要素是否形成好的结构。

每个人造系统都是有目标的，系统要素集能否达到目标要求，除了环境因素之外，要素间的相关关系如何即结构形式如何起决定作用。标准系统是人造系统，所以常常是先确立功能目标，而后根据目标来设计或调整标准系统的结构。对较为复杂的系统，也常常是将系统的总目标分解为各个子系统或各个层次的分目标，然后据以构造出分系统的组成要素以及它们的相互关系，最后形成整体协调的系统结构。

在标准系统的结构与功能的关系中，功能是个活跃的因素，它在系统内外各种因素相互作用的过程中不断发生变化，而结构一般是较稳定的，只有当功能变化到一定程度（如标准已不适应生产发展的客观需要）时，才能引起结构的部分改变（如某些标准修订或废止）或全部改变（如标准的重新制定）。而结构是功能发挥作用的内在依据，只有合理的结构才能促使标准功能的正常发挥。

在对标准系统进行宏观控制过程中，应不断分析功能与结构的关系，一旦发现结构状况已经影响了功能的发挥和目标的实现，就应采取措施改变结构。由此可见，即使已经构成为标准系统，如果结构不合理，标准之间的关系没有协调好，仍然产生不出较好的系统效应，这就提出了标准系统结构优化的问题。

依系统目标的要求，合理组合标准系统要素的阶层秩序、数量比例、时间序列及相关关系，使之稳定，并能产生较好的系统效应，这就是结构优化原理。其含义如下。

1.标准系统的结构是经过优化的结果，只有经过优化的系统结构，才能产生较好的系统效应。

2.标准系统的结构形式，总的来说是变幻无穷的，但阶层秩序（层次之间的关系）、数量比例（具有不同功能的标准间的构成比例）、时间序列（标准的寿命时间方面）和各要素之间的关系（主要是相互适应、相互协调的关系），以及它们之间的合理组合是结构形式的基本要素。结构优化就是按照结构与功能的关系，不断调整和处理标准系统中的矛盾成分和落后环节，保持系统内部各组成部分有个基本合理的配套关系和适应比例，以提高标准系统的组织程度，使之发挥出更好的效应。

3.标准系统只有稳定才能发挥其功能，经过优化后的标准系统结构，应该能够相对稳定。所谓稳定是指系统某种状态的持续出现，从而其功能可持续发挥。使标准系统保持稳定状态的方法，一是要使各相关要素之间保持相互协调的关系；二是处理好标准与环境的协调关系。

协调是结构优化的基本方法，也是标准化活动中普遍采用的优化方法。由于组成系统的各个标准，其特性和功能是相互依存的，所以任何一个标准，其特性和功能的变化，都意味着要对其相关的其他标准也进行相应的调整。通过各种途径使相关要素之间重新建立起相互适应的关系，求得稳定结构，这就叫做协调。

综合标准化就是通过对相关要素的整体协调建立标准系统，发挥系统效应的一种标准化方法。它是从总体效应（目标）出发，在对每个系统要素的功能透彻了解的基础上，再按照功能与结构的制约关系，把这些要素（标准）有机地组织起来，使要素间相互配合，形成理想的系统结构。这种方法不仅可以使系统结构优化，而且会随着标准化对象的发展，形成功能和结构互相促进、相得益彰的局面。