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2001年罗伯茨再次被提名进入巡回上诉法院。不过这次有一个问题。恰逢“布什诉戈尔案”的痛苦以及参议院被民主党控制这一事实意味着政府不得不步步谨慎。第一批被提名人名单为求平衡，除了温和的保守主义者还加入了一些比尔·克林顿试图推进巡回法院的法官。该被提名人名单顺利通过。后来政府开始推出一些更符合其司法哲学偏好的被提名人，这次民主党人予以了阻挠。他们拒绝召开有关罗伯茨提名的听证会。但2003年共和党人掌控参议院时，该提名得以推行。美国政府和罗伯茨请代表两党的一些华盛顿律师写了一封信，这些律师包括被称作华盛顿民主党统治集团“主席”的劳埃德·卡特勒（Lloyd Cutler），以及比尔·克林顿的总检察长赛斯·韦克斯曼（Seth Waxman）。他们呼吁快点儿召开听证会，声称：“我们一致认为约翰·罗伯茨会成为一名出色的联邦上诉法院法官。”通过口头投票罗伯茨的提名被予以确认，罗伯茨在巡回法院占据一席之地。