疾病预防控制中心实验室信息管理系统
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前言
PREFACE

实验室信息管理系统(LIMS)是现代信息技术、现代管理思想与现代分析技术等多学科交叉而诞生的一门新兴学科。伴随技术的进步,LIMS已经远远超出简单的实验室数据采集和存储,而是实现实验室信息与企业级计算环境的深度集成。同时,LIMS也不仅仅是软件,而是采用用户输入、数据采集、信息集成、数据分析、信息和报表传输来集成和涵盖实验室工作流程的整体解决方案。

近30年来,LIMS的研究与应用方兴未艾,并在世界范围内取得了令人瞩目的技术进展和应用成就。目前,LIMS已经在各种类型的实验室中得到了广泛的应用,对于工业企业而言,LIMS在保持和提高产品和服务质量、降低企业运行成本、实现管理标准化等方面发挥着巨大的作用。相对而言,LIMS在疾病预防控制领域的应用刚刚起步。

当前,我国各地区域医疗卫生机构信息化建设进入了新阶段,疾病预防控制机构作为区域公共卫生系统的重要组成部分,其信息化建设的速度显著加快。在当今疾控机构信息化大发展的重要阶段,疾控机构LIMS可以成为也应该成为疾控信息化建设的重要抓手。

实验室检验检测是疾病预防控制中心的核心业务之一,在公共卫生安全保障方面扮演着重要角色。省级疾病预防控制中心实验室年平均检验样品数十万个,业务量、数据量巨大;同时,省疾病预防控制中心实验室还承担着对基层实验室检验检测工作的指导任务。所以,除自身的检测任务和检测数据之外,还有大量管理任务和管理数据;除此之外,疾病预防控制中心实验室管理系统还必须考虑和疾控系统整体信息化建设,甚至区域人口健康信息化建设的配合关系。

因此,新时期疾病预防控制中心实验室信息化建设不仅仅是LIMS技术和工具的简单应用,还必须结合疾控行业的具体业务以及疾控信息化建设的整体规划进行有针对性的设计、优化和调整。这需要行业专家和IT专家的深度合作和共同努力。

本书结合疾控机构职责、目标,以及信息化的沿革,分析出实验室信息化的重要性,并结合编者在疾控信息化方面的行业实践和从事LIMS系统设计、实施、运维的大量经验,站在疾控信息化的大背景下阐述疾病预防控制中心LIMS系统建设的意义、目标和建设内容,对LIMS系统所涉及的信息技术进行了详尽的介绍,还结合大量案例对实施过程和实施效果进行了说明。本书可以帮助读者定位实现智慧疾控的路径,制定实验室信息化纵向采集、横向集成目标,通过利用信息集成、数据挖掘、人工智能等技术,实现疾控业务的智能化。全书共分为7章。

第1章 疾控机构信息化概述。疾病预防控制机构是由政府举办的实施疾病预防控制与公共卫生技术管理和服务的公益事业单位。旨在通过对疾病、残疾和伤害的预防控制,创造健康环境,维护社会稳定,保障国家安全,促进人民健康。疾控机构的实验室检验检测和现场流行病学调查在疾病预防控制中发挥着重要作用,尤其是实验室检验检测在重大传染病防控和突发公共卫生事件应急处置中发挥着“一锤定音”的作用。近年来,随着各种自动化大型分析仪器在疾控机构的广泛应用,传统的信息管理和分析模式已经不能满足当前需求,亟须一种高效、迅捷、安全的科学管理工具用于实验室信息管理。本章回顾了疾控机构发展历程,并对疾控机构目标任务以及信息化建设需求等内容进行了介绍。

第2章 疾控机构信息化建设框架。信息技术为疾病防控提供了新的工具和手段。疾病预防控制信息系统作为一个覆盖全国范围的信息化基础设施,其至关重要的是科学合理的顶层设计。我国疾病预防控制信息系统的建设思路经历了从“以疾病为中心”向“以人为中心”转变,相应地,在体系结构上也正在发生重要的调整,传统的网络直报的工作模式正在向多业务协同与融合发展的新模式转变。本章对疾病预防控制信息化建设的历程进行简单回顾,并对当前信息化建设的整体思路、技术路线和系统架构进行介绍,探讨疾控机构实验室信息管理系统在疾控信息化中的核心地位。

第3章 疾病预防控制中心实验室信息化建设内容。实验室信息管理系统可为各级政府主管部门提供及时、准确的统计数据和科学决策的依据,为社会公众、企业实现信息发布、公开,可以让全社会了解突发公共卫生事件等信息,对促进公共卫生环境改进、提高政府服务水平、协调经济全面发展具有积极的意义。本章对疾病预防控制中心实验室管理系统概念、框架、疾病预防控制中心一体化平台建设进行介绍,涉及实验室信息管理系统建设背景、建设目标、建设原则、建设定位、建设内容等。重点介绍疾病预防控制中心实验室信息管理系统层次框架,实验室内部、外部的数据流向,全省一体化网络实验室建设内容等。

第4章 实验室信息化应用技术。实验室信息管理系统是集现代化管理思想与基于计算机的高速数据处理技术、海量数据存储技术、网络宽带传输技术、自动化仪器分析技术于一体,以实验室业务和管理工作为核心,遵循实验室管理国际规范,实现对实验室全方位的科学、统一、有序和高效管理的计算机信息管理系统。本章重点介绍实验室信息化建设相关的要素、实验室信息化建设中基础设施及其选型关键点、系统集成技术、仪器数据采集技术、数据分析技术、信息安全技术等。

第5章 实验室信息化实施与验证。实验室信息化建设过程既系统,又复杂。建设过程涵盖项目启动—需求分析—系统设计—构建/配置—测试/调试—运行和维护—系统退役和停止使用的全生命周期。本章对读者使用不同的生命周期来维护现有的LIMS工具提供指导。验证对于许多实验室来说变得越来越重要,LIMS生命周期中每个阶段都要进行验证活动。验证过程贯穿从新系统规划开始到退役等多个阶段。验证不仅是为了符合管理要求,而且对于组织机构而言也是一个很好的工具,LIMS能按照要求去工作,会令人有信心。

第6章 疾控机构实验室信息化应用实践。成功的实验室实践案例可以帮助其他组织理解LIMS的建设过程,少走弯路。本章重点介绍了疾病预防控制中心等机构实验室信息化建设标准规范和应用示例。重点包括标准化编码体系、标准化管理流程、标准化过程表单、标准化检测方法、标准化质控手段、标准化资源管理、标准化权限管理体系等内容。实验室信息化应用示例介绍了贵州省疾病预防控制中心省、市、县一体化模式实验室信息管理平台,国家食品安全风险评估中心、深圳市疾病预防控制中心和北京市顺义区疾病预防控制中心在食品安全风险监测、检测质量监管、职业病监测等领域的特色应用与实践。

第7章 公共卫生信息化应用前景。在信息技术领域,云计算、大数据、物联网、人工智能、区块链等先进技术不断产生并推广应用。如何更好地发现、管理和利用好这些与组织密切相关的公共卫生大数据,更好地利用云计算、人工智能、区块链等技术手段,揭示公共卫生个体的独有特质并形成个性医疗,将公共卫生的宏观大势与每个微观个体定性定量描述有机结合,达到支撑和形成健康医疗行业新应用场景和新服务模式。一是为人类医疗集体经验的快速提升提供帮助,这种颠覆式创新将让每个人都成为控制自己疾病的主人;二是“取之不尽、用之不竭”的医疗数据创新是显性的,将带来极具商业价值的产业效应。

本书可为从事实验室信息化建设的管理者、IT工程技术人员提供技术支持;为疾控、医院、社区、妇幼等公共卫生机构的管理者、专业技术人员、实验室人员、质量管控人员、统计分析人员提供业务支持。也可为实验室信息化工具供应商,实验室信息化应用支持专家,软件实施、测试、验证人员提供支持。还可供相关专业的研究生及其他对实验室信息化技术有兴趣的人员使用。

在本书的编写过程中参考和引用了国内外很多书籍和网站的相关内容,部分图片素材和个别实例的初始原型也来源于网络,部分互联网相关资源无法一一列举出处,在此一并予以感谢。限于时间和水平,书中难免出现不足和疏漏之处,恳请广大读者将意见和建议反馈给我们,以便在后续版本中不断改进和完善。

编者

2019年12月