漱口水作为辅助性控制菌斑措施，主要利用的是抗菌药物的抑菌机制，比如常用的复方氯己定含漱液，通过和菌斑中细菌的细胞壁结合，抑制细菌活力，从而达到控制菌斑的效果。

漱口水使用方便，所以应用较广，但其只能作为辅助措施，口腔治疗的必要性和刷牙的效果是含漱液不能替代的。牙周炎患者必须要进行必要的刮治洁治。对普通人来说，作为日常控制菌斑最有效的措施还是刷牙和使用牙线。

此外还有一些特殊效用的含漱液，比如，含氟漱口液可以作为氟剂补充的有效方式，实施起来较为简单，但一定要注意年龄及用量。尤其有一些含有某些生物提取液的漱口水宣称有缓解牙龈炎症的效果，均应在医师指导下使用。一些患者认为漱口水能有效改善口气，但还是建议做详尽的检查及必要的治疗后在医师指导下使用，不然反而有可能掩盖原有的口腔疾患。

针对儿童来说，漱口水一般推荐给有特殊需求的患者，不建议儿童使用或长期使用。