中药分子鉴定技术与应用
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人参与西洋参、竹节参

【来源】

人参为五加科植物人参Panax ginseng C.A.Mey.的干燥根和根茎,西洋参(花旗参)为同科植物西洋参P.quinquefolius L.的干燥根,竹节参为同科植物竹节参P.japonicus C.A.Mey.的干燥根茎。

人参主根呈纺锤形或圆柱形,长3~ 15cm,直径1~ 2cm。表面灰黄色,上部或全体有疏浅断续的粗横纹及明显的纵皱,下部有支根2~ 3条,并着生多数细长的须根,须根上常有不明显的细小疣状突起。根茎(芦头)长1~ 4cm,直径0.3~ 1.5cm,多拘挛而弯曲,具不定根(艼)和稀疏的凹窝状茎痕(芦碗)。质较硬,断面淡黄白色,呈粉性,形成层环纹棕黄色,皮部有黄棕色的点状树脂及放射状裂隙。或主根多与根茎近等长或较短,呈圆柱形、棱角形或人字形,长1~ 6cm。表面灰黄色,具纵皱纹,上部或中下部有环纹。支根多为2~ 3条,须根少而细长,清晰不乱,有较明显的疣状突起。根茎细长,少数粗短,中上部具稀疏或密集而深陷的茎痕。不定根较细,多下垂。具有大补元气、复脉固脱、补脾益肺、生津养血、安神益智的功效。用于体虚欲脱、肢冷脉微、脾虚食少、肺虚喘咳、津伤口渴、内热消渴、气血亏虚,久病虚羸,惊悸失眠,阳痿宫冷。

西洋参呈纺锤形、圆柱形或圆锥形,长3~ 12cm,直径0.8~ 2cm。表面浅黄褐色或黄白色,可见横向环纹和线形皮孔状突起,并有细密浅纵皱纹和须根痕。主根中下部有一至数条侧根,多已折断。有的上端有根茎(芦头),环节明显,茎痕(芦碗)圆形或半圆形,具不定根(艼)或已折断。体重,质坚实,不易折断,断面平坦,浅黄白色,略显粉性,皮部可见黄棕色点状树脂道,形成层环棕黄色,木部略呈放射状纹理。具有补气养阴清热生津的功效。用于气虚阴亏,虚热烦倦,咳喘痰血,内热消渴,口燥咽干。

竹节参略呈圆柱形,稍弯曲,有的具肉质侧根。长5~ 22cm,直径0.8~ 2.5cm。表面黄色或黄褐色,粗糙,有致密的纵皱纹及根痕。节明显,节间长0.8~ 2cm,每节有1凹陷的茎痕。质硬,断面黄白色至淡黄棕色,黄色点状维管束排列成环。具有散瘀止痛,消肿止痛、祛痰止咳,补虚强壮的功效。用于痨嗽咳血,跌打损伤,咳嗽痰多,病后虚弱。

人参自古受东方医药学者重视,而近年研究人参的各种生化机理的成果也不少,所以基因数据库(GenBank)内存有大量DNA序列,其中整个叶绿体DNA序列已公开,研究人员可从中查阅数据,用作设计特异性引物或探针。人参属珍贵药材,具经济价值,有多种伪品或替代品充斥市场,例如其他人参属植物包括三七P.notoginseng、羽叶三七(珠子参)P.major和三叶参P.trifolius,商陆科植物商陆Phytolacca acinosa、紫茉莉科植物紫茉莉Mirabilis jalapa、桔梗科植物桔梗Platycodon grandiflorus以及马齿苋科植物土人参Talinum paniculatum等。

【分子鉴定技术】

一、AP-PCR和RAPD

Shaw等(1995)以RAPD及AP-PCR对3种人参属植物及其伪品进行测试(表5-2-1a)。将RAPD和AP-PCR图谱结果输入分析软件,计算物种间的相似度(Similarity Index,SI),发现人参和西洋参的SI值最高。使用OPC5引物得出RAPD图谱(图5-2-1),样本包括人参、西洋参及三七种间的图谱各有差异,但种内一致。以TCS反向引物所得的图谱显示(图5-2-2),包括3种人参属植物(人参、西洋参及三七)及其伪品的样本,所有品种都各具独特图谱。在市场上收集8种人参产品,使用6种AP-PCR引物来鉴定,对比人参的特征谱带,从而确定样本的品种来源。该8种产品再以HPLC化学方法验证,跟AP-PCR相互比对下,两种方法的结果吻合,证明AP-PCR的可靠性高。

图5-2-1 西洋参、人参和三七的RAPD指纹图谱(图谱源自Shaw等,1995)

1~ 7:不同产地的西洋参;8~ 10:不同产地的人参;11:三七;M:100bp分子标记物

图5-2-2 西洋参、人参及其伪品的AP-PCR指纹图谱(图谱源自Shaw等,1995)

1:西洋参;2:人参;3:桔梗;4:紫茉莉;5:土人参;6:商陆;7:阴性对照;M:100bp分子标记

马小军等(1999)用RAPD分析野生人参的多态性(表5-2-1b)。样本包括7个来源地不同的野山参和1个园参样本。经筛选后发现其中14个随机引物具多态性,共扩增111条谱带,当中76条是多态的。将西洋参以同样方法分析,然后绘制亲缘关系树,能明显将人参和西洋参区分。

任跃英等(2005)对人参植物栽培品系(黄果人参、红果人参)与西洋参植物栽培品系(黄果西洋参及红果西洋参)进行的RAPD图谱分析(表5-2-1c)。共采用15个随机引物,得出131条谱带,其中14个引物的谱带有多态性。尤其4条引物在4个组别(红果人参、黄果人参、红果西洋参、黄果西洋参)具有多态性,可作鉴定之用。

二、AFLP

Ha等(2002)使用AFLP进行人参和西洋参的鉴定(表5-2-2a)。用限制性内切酶Eco RⅠ及MseⅠ将基因组DNA酶解,然后加入Eco RⅠ接头、MseⅠ接头以及连接酶,将片段两端各连上不同的接头。在预扩增反应中,使用预扩增AFLP引物Eco RⅠ+A及MseⅠ+C,退火温度56℃,得到预扩增产物。在选择性扩增反应中,以预扩增产物作为模板DNA,加入选择性AFLP引物Eco RⅠ和MseⅠ,发现Eco RⅠ-AGG与MseⅠ-CAA这对引物不单可用于鉴定人参与西洋参(图5-2-3,图5-2-4),甚至可用来区分不同产地的人参样本。将指纹图谱输入分析软件包,计算出中国和韩国产的人参的SI值较高(0.88~ 0.99),但不同产地的西洋参,其SI较低。对韩国汉川产人参样本的一个多态性谱带进行测序,于NCBI数据库检索后,发现片段含8个22bp的微卫星重复序列。根据这22bp序列合成引物,并对人参及西洋参的总DNA进行PCR扩增,结果得出多条大小由800~ 1600bp的谱带。微卫星重复序列大概10~ 60bp,研究显示重复序列常位于染色体的尾端,或与DNA复制的滑脱、移位有关。这些串联重复序列可作为杂交技术的指纹图谱探针。

图5-2-3 人参的AFLP指纹图谱(图谱源自Ha等,2002)

1~ 2:吉林集安;3~ 4:辽宁新宾;5~ 7:韩国江原;8~ 10:韩国抱川;11~ 13:韩国寒川;14~ 17:韩国锦山;18~ 20:韩国金铺;黑色箭头为人参特异性谱带,浅色箭头为人参和西洋参共有谱带

星号(*)表示该谱带可作DAMD分析的微卫星重复序列

图5-2-4 西洋参的AFLP指纹图谱(图谱源自Ha等,2002)

1:加拿大安大略省;2~ 3:加拿大英属哥伦比亚省;4:加拿大某农场;5:美国某农场;6:美国威斯康星

黑色箭头为西洋参特异性谱带,浅色箭头是人参和西洋参共有谱带

罗志勇等(2000)同样以AFLP构建人参、西洋参和引种西洋参的基因组图谱(表5-2-2b)。限制性内切酶和接头同样是Eco RⅠ和MseⅠ,只是选择性AFLP扩增反应的引物不同(和),其中Eco RⅠ端的引物(Eco RⅠ-AA)比前述Eco RⅠ-AGG少了一个碱基,且A变换G,而MseⅠ-CAG比前述MseⅠ-CAA变换一个碱基(G替代A)

三、DALP

Ha等(2001)对不同产地的人参和西洋参进行DALP分析(表5-2-3a),共测10个引物,最后确定选择性引物DALP001及反向引物DALPR1为最佳组合。为减少因反向引物变短而带来的背景干扰,将退火温度调整至55℃,就能产生独特清晰的指纹图谱(图5-2-5)。在众多的谱带中,选取人参多态性谱带Pg636进行测序。谱带全长636bp,根据谱带序列在两端设计人参特异性引物Pg.F及Pg.R,退火温度70℃。使用该对引物对人参及西洋参的总DNA进行PCR扩增,发现所有人参样本均出现一条636bp的谱带,而西洋参样本则为空白。经比对基因数据库(GenBank),发现Pg636上184~ 198nt位置有5组三核苷酸微卫星重复序列(CAT)。将序列其中2~ 62nt及70~ 115nt翻译成蛋白质然后比对,发现其氨基酸序列跟伞形科欧芹Petroselinum crispum的相似度分别达71%和80%。

图5-2-5 人参和西洋参的DALP指纹图谱(图谱源自Ha等,2001)

1~ 7为不同产地人参(1:吉林集安;2:辽宁新宾;3:韩国江原;4:韩国抱川;5:韩国寒川;6:韩国锦山;7:韩国金铺);8~ 13为不同产地西洋参(8~ 9:加拿大英属哥伦比亚;10~ 11:加拿大安大略;12~ 13:美国威斯康星)

每个样本进行两个独立的PCR反应(S和R),箭头显示人参的多态性谱带

王琼等(2004)建立10个野山参、4个栽培人参及1个移山参的DALP图谱,寻找样本之间的特异性差异(表5-2-3b)。共筛选“选择性引物”与“反向引物”各2个。经优化条件后,得知配合selective 01及reverse 03引物进行PCR扩增便可获得最清晰的图谱。结果显示其中9个野山参样本均有一条约250bp的特异性谱带,3个栽培品和1个移山参在约200bp位置上出现一条谱带,但野山参却是空白。根据DALP图谱,发现野山参的多态性比栽培品高,而栽培品和移山参差异不大,证明两者亲缘关系接近。

四、PCR-RFLP

Fushimi等(1997)将人参、西洋参及竹节参的18S rRNA基因序列以软件分析其所含内切酶点,发现限制性内切酶BanⅡ和DdeⅠ能区分三种参类(表5-2-4a)。人参的18S rRNA上共有3个BanⅡ限制性位点,而竹节参和西洋参比人参多出1个(492~ 497nt)。在BanⅡ酶切后,图谱上人参只有三条谱带(258bp、560bp和991bp),而竹节参及西洋参则有四条(258bp、482bp、499bp和560bp)。因此BanⅡ可将人参从西洋参和竹节参中区分出来。另一方面,三者的18S rRNA上都有6个位置相同的DdeⅠ限制性位点,但西洋参比人参和竹节参在495~ 499nt多出1个DdeⅠ限制性位点。图谱上人参和竹节参出现7个片段,而西洋参则有8个片段,其中6个片段长度相同,人参和竹节参的第7个片段长度为845bp,而西洋参因在该位片段内有一个DdeⅠ限制性位点,所以变成95bp及750bp两个片段。因此,限制性内切酶BanⅡ或DdeⅠ可用作3种人参属植物和参类药材的PCR-RFLP鉴别分析(图5-2-6)。

图5-2-6 人参属植物的18S rRNA基因PCR-RFLP图谱(图谱源自Fushimi等,1997)

酶切:A:Ban II;B:Dde I。

1:人参植物;2:竹节参植物;3:西洋参植物;4:人参生药;5:竹节参生药;6:西洋参生药;7:1kb-ladder分子标记物

马小军等(1998)结合RAPD和RFLP两项技术,对3种人参农家品系(大马牙、二马牙和圆膀圆芦)进行分析(表5-2-4b)。经筛选不同随机引物后,选择了OPY-09和OPK-18扩增,OPY-09得到2条分别是960bp和600bp谱带,OPK-18则只有一条600bp谱带。然后用限制性内切酶RsaⅠ、AluⅠ、MspⅠ分别对两者的产物进行酶切,其中OPK-18比OPY-09多用一种限制性内切酶Hin fⅠ。结果发现3个人参品种的图谱均是相同的。

Ngan等(1999)比较人参、西洋参、紫茉莉和商陆等4个受测品的ITS区域后,发现其中存在不同的内切酶位点(表5-2-4c)。使用引物18d和28cc进行PCR扩增,然后分别用限制性内切酶Hin fⅠ、TaqⅠ及Sau3A进行酶切。结果显示4个受测品种都有其特异性图谱,本技术可轻易将4者区分。通过测试该技术的灵敏度,即将不同比例的人参和西洋参混和(1∶1、3∶7、1∶9),重复以上程序。结果显示数量低至10%的人参亦能以此法检测。

五、ARMS

Fushimi等(1997)对人参、西洋参及竹节参进行ARMS分析,比较三者的18S rRNA序列,然后在481~ 499nt(或501nt)位置上,设计3个种特异性正向引物Pgin481F、Pjap481F和Pqui481F(表5-2-5a),分别对应人参、竹节参和西洋参的碱基替换,反向引物为18SR。用人参特异性引物Pgin481F进行PCR扩增,只有人参产生1个1329bp的片段(图5-2-7A)。用西洋参特异性引物Pqui481F时,只有西洋参产生1个1329bp的片段(图5-2-7B)。但用竹节参特异性引物Pjap481F进行PCR时,西洋参和竹节参都出现扩增片段。因此对Pjap481F引物的PCR特异扩增条件进行优化,采用这种改进的PCR条件,西洋参的DNA未产生扩增片段(图5-2-7C)。由此可见PCR的条件及所设计的种特异性引物在ARMS分析的重要性。

图5-2-7 人参属植物的ARMS分析(图谱源自Fushimi等,1997)

A:人参特异性引物Pgin481F B:竹节参特异性引物Pjap-481F C:西洋参特异性引物Pqui481F。

1:人参植物;2:竹节参植物;3:西洋参植物;4:人参生药;5:竹节参生药;6:西洋参生药;7:1kb-ladder分子标记物

六、SCAR

Wang等(2001)使用OPC20(ACTTCGCCAC)引物对人参及西洋参进行RAPD分析,找出西洋参特异性谱带(RAPDAG)并对其进行测序。根据序列结果设计两对SCAR引物,分别是SCAR.F1和SCAR.R1以及SCAR.F2和SCAR.R2(表5-2-6a)。第一对引物所扩增的谱带为350bp,第二对则是419bp。对8个不同产地的人参样本,经两对引物扩增后,所得谱带都比西洋参的短了25~ 30bp。此外,亦尝试运用SCAR.F1和SCAR.R1引物对其他人参属植物如竹节参、三叶人参、三七以及人参伪品紫茉莉和商陆进行SCAR鉴别(图5-2-8),其图谱都与人参和西洋参的截然不同。比较使用的RAPD及SCAR引物,便发现后者比前者长,所以可靠性及准确性比RAPD高。

图5-2-8 人参属植物及其混淆品的SCAR图谱(图谱源自Wang等,2001)

1:吉林集安产人参;2:韩国金铺产人参;3:加拿大安大略产西洋参;4:美国威斯康星产西洋参;5:竹节参;6:珠子参;7:三叶人参;8:三七;9:紫苿莉;10:商陆;M:100bp分子标记物

除了RAPD外,其他技术所得的谱带也可转化成SCAR。Choi等(2008)对竹节参、西洋参及人参进行AFLP分析,发现选择性AFLP引物Eco RⅠ-TA和MseⅠ-GTT能产生15条竹节参特异性谱带,对谱带JG14进行克隆及测序,总长度为293bp。依据序列设计引物JG14F和JG14R(表5-2-6b)对竹节参扩增后,会得出一条191bp的谱带,但对人参、西洋参和三七等均不能扩增,从而到达鉴别目的。

七、SNP

宋沁馨等(2009)比对人参和西洋参两者的ITS和5.8S rRNA序列,发现序列上的252nt和430nt出现SNP位点。以此差异设计出公共引物P1、人参特异性引物ASA-1和西洋参特异性引物ASA-3(表5-2-7a)。同时设计两条人工错配引物(人参ASA-2和西洋参ASA-4)。特异性引物和人工错配引物的区别在于3’末端倒数第3个位置,改为1个不匹配碱基,用以抑制错配现象。加入公共引物P1、人参特异性引物ASA-1、西洋参特异性引物ASA-3和其他PCR试剂。当加入人参模板DNA时,会跟公共引物和人参特异性引物互补,人参扩增片段为252bp,西洋参的是430bp。将人参和西洋参以不同比例混合,结果表明可测出低至5%的掺杂品种。当未加入人工错配引物ASA-2和ASA-4时,检测结果会出现2条谱带,证明所设计的人工错配引物能有效阻止非特异性扩增。

八、ALM-ASA

宋沁馨等(2008)选择人参和西洋参ITS和5.8S rRNA序列2个SNP特异点以ALMASA方法鉴定人参和西洋参(表5-2-8a)。第一步以预扩增引物S1和A1进行扩增。第二步是用限制性内切酶将扩增物切成多段,其中一个酶切点位于两个SNP之间,因此该2个SNP位点分别位于2条酶切片段之中。第三步加入适配器及连接酶,连接酶会将片段的两端都连上适配器。适配器的其中一端含HaeⅢ切口粘性末端,另一端是一长一短的碱基链(称长臂和短臂),长臂比短臂多出的碱基,其序列跟公共引物Pu是相同的,所以Pu在PCR过程中不能跟长臂结合,只有当长臂的互补区域被伸延后,Pu才可与之结合然后被用作扩增。第四步进行PCR扩增,加入扩增用公共引物Pu,人参特异性引物ASA-1、西洋参特异性引物ASA-2以及PCR试剂。ASA-1和ASA-2的3’末端位于SNP位点,在3’末端倒数第三个位为一不匹配碱基,用作加强引物的特异性。当PCR扩增时,特异性引物只会跟相关的SNP位点融合,然后伸延至配适器的长臂序列。当长臂的互补区域出现后,公共引物Pu便会跟区域结合,然后进行反方向的伸延,所以SNP点与配适器这一段区域便会不断扩增。相反,如果特异性引物未能跟SNP融合,那么将无法进行PCR。人参和西洋参的扩增谱带分别是249bp及111bp。如果混合人参和西洋参,便会得两条谱带。之后依此法设计三七及竹节参的特异性引物,分别得到长度是245bp和149bp的谱带。因此ALM-ASA方法可以对人参、西洋参、三七、竹节参等进行鉴别。

九、DNA测序

Fushimi等(1996)对3种人参属植物人参、西洋参、竹节参的18S rRNA区域进行扩增,引物为18S F和18S R(表5-2-9a),序列长度均是1809bp,三者的序列相似度高达99.8%,只在497、499、501和712位置上发现碱基替换。药材和原植物序列相同。另外,对2个人参生药样本、2个竹节参植物标本进行序列测定,发现它们之间没有差异,因而表明18S rRNA基因序列在人参属植物和参类药材是稳定的,与栽培环境无关。在3种人参属植物18S rRNA基因序列中,碱基替换集中在500nt位置左右。通过与其他种rRNA基因序列同源性检索,结果显示与西红柿Solanum lycopersicum、大豆Glycine max同源性最高,达97.4%。

Fushimi等(1997)对3种人参属植物人参、西洋参、竹节参的mat K区域进行扩增,引物为matK AF和matK 8R(表5-2-9a),序列长度均是1259bp,人参与竹节参的序列完全相同,而西洋参仅在第102nt位置发生一个碱基转换,由A转成T。

Ngan等(1999)对人参、西洋参、三七、竹节参、羽叶三七、三叶参、紫茉莉以及商陆ITS进行测序检测,所用引物为18d和28cc(表5-2-9b)。对于5.8S rRNA基因,6个人参属植物相似度达98.8%~ 99.4%,其中竹节参和羽叶三七的序列则是相同的。而在ITS序列,6个人参属品种和2个伪品的相似度只有62%,而6个人参属之间的相似度达92.8%~ 99.4%,因此可轻易区分。

十、DNA芯片

Zhu等(2008)设计一个DNA芯片用作快速区分8个人参属品种,他们选定18S rRNA作为设计探针的DNA部位,经比对8个人参属和1个五加属品种的序列后,发现利用当中的11个差异点,便可将所有受测品种区分。按照这些差异点,设计出33个特异性探针(表5-2-10a),并加上1个阳性和1个阴性对照探针。阳性对照探针长度为27bp,在8个受测人参属植物的18S rRNA上都存在,因此,所有人参属植物都会发出讯号。阴性对照探针长度25bp,是一个随机设计探针,理论上该位置不会发出任何讯号。33个特异性探针长度介于23~ 26bp,差异点置于探针的中间。按照差异点在18S rRNA上的出现位置,顺序将探针点样,固定在芯片上,而每个探针会重复点样3次,以确保所得讯号可靠。首先利用引物18S 5’F和18S 800R 5’将部分的18S rRNA区域扩增,纯化后进行修饰,于PCR产物末端加上荧光标记物Cy5。之后加入杂交缓冲液,然后置于DNA芯片上,在68℃环境下杂交2小时,之后进行清洗,扫描影像,最后以软件分析。结果显示所有人参属品种,都会在相对应的位置上发出讯号,实验证明DNA芯片能快速区分不同人参属植物。另外对5个人参属商品进行检测,发现2个是人参,2个是西洋参,1个是三七。所有样本的检测结果,都与其标识成分吻合,之后再以HPLC测试,两者结论相同。

十一、LAMP

Sasaki等(2008)比较人参及竹节参两者的18S rRNA区域后,发现序列上第497及501 nt位置上出现差异,于是在401~ 600nt之间设计6个引物(表5-2-11a),包括4个LAMP引物PG-F3、PG-B3、PG-FIP、PG-BIP和2个loop引物PG-LF、PG-LB。PG-FIP和PG-BIP的5’端的第一个碱基只会与人参的第501和497点互补,但与竹节参则不能。加入受测人参模板DNA和其他试剂,置于63℃培养60min。在扩增反应时,释放出的焦磷酸离子(pyrophosphate ion)会和试剂中的镁离子结合,令试剂变成混浊。相反,当加入竹节参的模板DNA,因为引物PG-FIP和PG-BIP的5’端不能与竹节参模板DNA互补,所以无法进行扩增,试剂最后是清澈的。因此研究加入不同浓度的人参的模板DNA,结果表明,浓度越高结果显示越快,而检测灵敏度达0.5ng。只要引物设计合适,LAMP技术比其他PCR为基础的方法更加方便快捷。

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表5-2-1 RAPD和AP-PCR应用例子的样本及技术参数

表5-2-2 AFLP应用例子的样本及技术参数

表5-2-3 DALP应用例子的样本及技术参数

续表

表5-2-4 PCR-RFLP应用例子的样本及技术参数

表5-2-5 ARMS应用例子的样本及技术参数

表5-2-6 SCAR应用例子的样本及技术参数

续表

表5-2-7 SNP应用例子的样本及技术参数

表5-2-8 ALM-ASA应用例子的样本及技术参数

表5-2-9 DNA测序应用例子的样本及技术参数

表5-2-10 DNA芯片应用例子的样本及技术参数

续表

表5-2-11LAMP应用例子的样本及技术参数