水系

新疆的水文情况具有明显的干旱环境特点，河流除额尔齐斯河属外流河外，其余均属内流河。湖泊则以咸水湖居多，淡水湖较少。虽然境内的河流数量多，但流程短，流量小，多无航运之利。多数河流可分为径流形成区和径流散失区，其分界点在山口。自治区内的地表径流几乎全来自山区，地区分布西部多于东部，北疆多于南疆。共有大小河流570条，年径流量约为810亿立方米。其中，北疆有河流387条，南疆有河流183条。额尔齐斯河发源于阿尔泰山东南，是中国属北冰洋水系的唯一河流，也是新疆境内唯一的外流河；塔里木河是中国干旱地区中最长的内流河，穿流于塔里木盆地北缘；伊犁河穿行于伊犁河谷，是新疆境内水量最大的内流河。主要湖泊以罗布泊为较大，现已干涸。博斯腾湖是中国最大的内陆淡水湖，艾丁湖则为中国海拔最低的湖泊。此外，还有乌伦古湖、艾比湖、赛里木湖、巴里坤湖等及著名的天池。

塔里木河

塔里木河是塔里木水系的下游，位于新疆维吾尔自治区塔里木盆地的北部，如果包括上游的叶尔羌河，是中国最长的内流河。塔里木河下游由源于天山的阿克苏河和发源于昆仑山的和田河及叶尔羌河汇聚而成。塔里木河原以罗布泊为归宿，后尉犁县堵坝引水，使塔里木河改道南流，以若羌县的台特马湖为终点。1972年以后两岸利用洼地蓄水，塔里木河终点从台特马湖退缩到铁干里克的大西海子水库。河长逐渐缩短。而且从19世纪以来，塔里木河上游支流灌溉区农垦面积在不断扩大，原流入塔里木河的支流，如喀什噶尔、台兰、渭干、库车、迪那、孔雀等河，现均已断流，使塔里木河的补给来源逐渐减少。为了保证塔里木河的水源，保护塔里木河流域的自然环境已成为南疆开发整治的重要任务。

罗布泊

罗布泊就是地理概念上的塔里木河尾闾。位于新疆维吾尔自治区塔里木盆地东部罗布洼地上。湖的位置几经改变，但均在罗布洼地范围内。传说中罗布泊在不断地游移，事实上，所谓罗布泊游移，只是塔里木河尾闾位置的变动，湖盆本身并不游移。在封闭性的内陆盆地平原地区，河流下游经常自然改道，改道后的河流终点形成新湖泊，旧湖泊则逐渐干涸，成为盐泽。现今地图上所标示的罗布泊都已干涸，但作为塔里木河终点这一地理概念的罗布泊，并未消失。罗布泊的最近地理位置是铁干里克西边的大西海子水库，至于罗布泊的未来，只要合理安排塔里木河上下游用水关系，铁干里克水库不但能继续存在，并可能放水给下游的阿拉干和罗布庄。如果塔里木河由自然河道改为渠化河道，两岸农垦规模不再扩大，在合理用水条件下，大西海子水库亦可能继续存在，并向下游泄放一些水量。

赛里木湖

博乐市境内西南部的赛里木湖比天池面积大93倍，达457平方千米，是天山最大的高山湖。赛里木湖南岸有鄂勒著依图博木军台，又名“三台海子”。湖面海拔2073米，湖水最深85米。湖四周雪峰环抱，湖水清澈碧透，湖水透明度在12米以上，是中国目前已测定的湖泊透明度最大、水体最清澈的湖泊之一。湖水化学成分以硫酸盐为主，属微咸水型湖泊。湖围高山海拔3600米以上为冰川和永久积雪带，2800米～3000米为高山草原，2800米以下直至湖滨为云杉林带。湖区周围深水量超过500毫米，湖水收入来自大气降水和湖周山地坡面径流，湖水支出为湖面蒸发及少量渗漏。湖周水草丰美，为优级夏季牧场，现已划为自然保护区。

天鹅湖

在新疆和静县尤尔都斯盆地、巴音布鲁克草原的中心地带，是开都河的发源地。尤尔都斯盆地是天山中高位山间盆地，是中、新生代复合型断陷盆地，包括大、小尤尔都斯盆地。小尤尔都斯盆地东高西低，开都河上游东支从盆地中间流过，大尤尔都斯盆地西北高东南低，开都河上游西支从盆地中间流过。东西支汇合后从盆地东南部切空山地流向焉耆盆地。盆地地势平缓，河流纵横，河道两旁小奚、涌泉无数，形成面积约1000平方千米的天鹅湖自然保护区，这里人烟稀少，水草丰茂，食物充足，沿岸蒲草、酸模等挺水植物高大挺拔，筑起一道绿色屏障，已成天鹅等候鸟、留鸟和旅鸟生存的理想场所。

博斯腾湖

博斯腾湖位于天山山脉南面的焉耆盆地内，是一个山间陷落湖，也是新疆最大的淡水湖，中国最大的内陆淡水湖。中国史书对博斯腾湖早有记述，现今湖体可分为大小湖两部分，湖水的补给主要来自开都河。博斯腾湖的水产资源十分丰富，湖中盛产鱼类，品种繁多，是新疆最大的渔业区，芦苇也是湖区物产，芦苇塘面积280多平方千米，年产芦苇30万吨，品质极高，是造纸、编织和建筑的优质材料。湖的东南岸连接一个盐湖，盛产纯净洁白的食盐。湖畔绿洲和河流两岸，土地肥美，灌溉便利，农牧业较发达，有“北国江南”的美誉，盛产各种瓜果，如杏、李、西瓜、葡萄等，著名的库尔勒梨（即瀚海梨）也是这里的物产。整个湖区风景秀丽，碧波浩淼，坐落在群峰起伏的天山支脉库鲁克山下，有“瀚海明珠”之称。湖边茂密的芦苇叶中，还栖息着各种水鸟。

艾丁湖

艾丁湖位于新疆吐鲁番盆地最低洼处，是中国大陆的最低点。因位于觉洛塔格山下，又称觉洛浣。觉洛浣是指沙子包围的湖泊。湖泊比海平面低154.31米，是世界上仅次于西亚死海、非洲阿萨勒湖的第三低地，湖盆东西长约40千米，南北宽仅8千米。水源来自博格达山的河川径流及火焰山泉水、山前平原地带的坎儿井水，这些水源均以地下水的形式补给。湖盆的自然环境均为草木不长的盐漠。

喀纳斯湖

喀纳斯湖位于新疆最北部的阿勒泰地区的哈纳斯河中段，哈纳斯，蒙古语意为“美丽富饶、神秘莫测”。海拔1370米的喀纳斯湖隐匿在重峦叠嶂、万顷林海之间，属典型冰碛湖。湖水颜色随季节和天气变化而变换，或湛蓝，或碧绿……湖中岩岛小巧玲珑、劲松挺立、满岛苍翠。湖周天然倒木纵横，倒木入水后受强劲谷风的运送，自动逆水而上，在湖泊上堆积成千米的枯木长堤，为一大奇观。湖边为水草丰美的牧场，湖中常有天鹅、野鸭等嬉戏。喀纳斯湖集湖光山色、珍禽与原始生境于一体，成为一个不可多得的高山游览胜地。