第二节 肽
L-α-氨基酸通过肽键聚合形成蛋白质的多肽链。有的蛋白质仅由一条多肽链组成,如溶菌酶和肌红蛋白,这些蛋白质称为单体蛋白质(monomeric protein)。有些蛋白质是由两条或多条肽链组成,如血红蛋白(2条α链和2条β链),这些蛋白质称为寡肽(oligomeric)或寡聚(multimeric)蛋白质;其中每条多肽链称为亚基(subuint),亚基之间通过非共价力缔合在一起。
一、肽和肽键的结构
一个氨基酸的α-羧基与另一个氨基酸的α-氨基脱水缩合而成的化合物叫肽。氨基酸之间脱水后形成的键叫肽键,亦称酰胺键。肽键的形成如下:
由2个氨基酸通过肽键连接而成的化合物称二肽(dipeptide),由3个氨基酸通过肽键连接而成的化合物称三肽(tripeptide),依此类推,由多个氨基酸通过肽键连接而成的化合物称多肽(polypeptide)。一般来说由2~10个氨基酸组成的肽称寡肽(oligopeptide),由10个以上氨基酸组成的肽称多肽,但这种规定并不严格。肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基团不全,被称为氨基酸残基(residue)。
氨基酸之间通过肽键连接而成的链称肽链(peptide chain),可用下式表示:
多肽链(polypeptide chain)中氨基酸残基的排列顺序称为氨基酸序列。多肽链有两端:有游离氨基的一端为N末端,有游离羧基的一端为C末端。应该指出,肽链也像氨基酸一样具有极性(polarity),书写时通常把氨基末端(N端)的氨基酸残基放在左边,羧基末端(C端)的氨基酸残基放在右边。即肽链书写方式:N端→C端。
用三字母符号或单字母符号表示氨基酸残基,用“—”或“·”表示肽键。下面结构式表示的是四肽,命名为丙氨酰甘氨酰亮氨酰苏氨酸,简写为Ala—Gly—Leu—Thr或Ala·Gly·Leu·Thr。现在光盘数据库中,为方便起见,上述肽直接用AGLT表示。
二、肽键的特点
肽键又称酰胺键,由于键内原子处于共振状态而表现出较高的稳定性。在肽键中C—N单键具有约40%双键性质,而CO双键具有40%单键性质。这样就产生两个重要结果:①肽键的亚氨基在pH0~14的范围内没有明显的解离和质子化的倾向;②肽键中的C—N单键不能自由旋转,这在多肽和蛋白质折叠形成特定的构象过程中起着非常重要的作用。肽基的C、O和N原子间的共振相互作用见图1-20。
图1-20 肽基的C、O和N原子间的共振相互作用
因为C—N具有双键的性质不能自由旋转,形成肽键的4个原子(C、O、N、H)和与之相连的2个α-碳原子共处在一个平面上,称为肽平面或酰胺平面(图1-21)。在肽平面内,2个Cα原子可以处于顺式或反式构型。在反式构型中,两个Cα原子及其取代基团互相远离;而在顺式构型中彼此接近,引起Cα上的R基之间的位阻。所以反式构型比顺式构型稳定,两者相差8kJ/mol。因此,肽链中的肽键都是反式构型(图1-22)。
图1-21 肽键和肽平面
图1-22 相邻的α-碳呈现反式结构
肽单位是肽链主链上的重复结构(由构成肽键的4个原子和两侧的Cα原子组成的结构单位)。实际上每个肽单位就是一个肽平面。
三、肽的理化性质
(一)两性解离与等电点
肽与氨基酸一样具有酸、碱性质,它的解离主要取决于肽链的末端氨基、末端羧基和侧链R基。小肽的理化性质与氨基酸类似。晶体的熔点很高,是离子晶体,在水溶液中以兼性离子存在。在长肽或蛋白质中,可解离的基团主要是侧链R基。肽至少有一个游离的氨基和游离的羧基,也是两性化合物,至少有二级解离,通常都有多级解离。因此肽在水溶液中也能够带电荷,也有自己的等电点pI,其计算和测定与氨基酸相同。
(二)肽的旋光性及紫外吸收
如果在相当温和条件下进行蛋白质的部分水解,不对称α-碳原子不会发生消旋作用,则所得的肽具有旋光性。一些短肽的旋光度约等于组成该肽中各个氨基酸的旋光度之和。但较长肽链的旋光度就不是简单的加和,而是比累加的和小得多。
如对一个肽在紫外吸收区进行光吸收扫描,发现在波长215nm处有一个大的吸收峰,这是肽键的吸收峰,因而可用此作为肽的定量测定。
(三)肽的化学性质
肽的化学性质与氨基酸相似,如茚三酮反应、Sanger反应、丹磺酰氯(DNS)反应和Edman反应等,但肽有与氨基酸不同的特殊反应——双缩脲反应。一般含有两个或两个以上肽键的化合物都能与CuSO4碱性溶液发生双缩脲反应而生成紫红色或蓝紫色的复合物。此反应是肽和蛋白质特有的反应,游离氨基酸无此反应。利用这个反应可以测定蛋白质的含量。
四、天然活性肽
动物、植物和细菌细胞中含有多种低分子量多肽(3~100个氨基酸残基)。这类多肽具有重要的生理活性,如脑啡肽、激素类多肽、抗生素类多肽、谷胱甘肽和蛇毒多肽等。
谷胱甘肽(Glu—Cys—Gly)简写为GSH,全称为γ-谷氨酰半胱氨酰甘氨酸。其巯基可被氧化、还原,故有还原型谷胱甘肽(GSH)与氧化型谷胱甘肽(GSSG)两种存在形式。
谷胱甘肽具有重要的生理作用:与毒物或药物结合,消除其毒性作用;作为重要的还原剂,参与体内多种氧化还原反应;还可使巯基酶的活性基团—SH维持还原状态;消除氧化剂对红细胞膜结构的破坏作用,维持红细胞膜结构的稳定等。